Sie wurden wegen Gehorsams gezüchtet.
Und sie müssen dem gehorchen, der den Befehl gegeben hat, Mr. Palpatine. Sie haben also nicht wirklich die Seite gewechselt.
Im Falle von Jedi-Offizieren, die gegen die Interessen der Republik handeln und nach Erhalt bestimmter Befehle bestätigt wurden, dass sie direkt vom Oberbefehlshaber kommen ( Kanzler), Kommandeure der GAR (Große Armee der Republik) werden diese Offiziere mit tödlicher Gewalt entfernen, und das Kommando der GAR wird an den Oberbefehlshaber (Kanzler) zurückgegeben, bis eine neue Kommandostruktur eingerichtet ist.
Es war die ganze Zeit sein Plan, einen falschen Krieg zwischen der Droidenarmee und der Klonarmee zu führen (tatsächlich die Klonarmee aufgrund der falschen Bedrohung durch die Droidenarmee zu schaffen), um die Aufmerksamkeit abzulenken, die Jedi zu beschäftigen, und eliminiere sie in diesem einen schnellen Schlag.
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Verwenden Sie den Angriff von Mace Windu als Vorwand, Palpatine erteilt Order 66, ein vorab vereinbartes Militärkommando, das allen Clone Troopers befiehlt, ihre Jedi-Kommandeure hinzurichten, falls die Jedi die "verraten" Republik. Darth Vader führt den Überfall auf den Jedi-Tempel mit der 501. Clone Trooper Legion an und tötet alle Jedi im Tempel, einschließlich der im Tempel lebenden Jedi-Jungen.